Deeper insights into the regulation of the xylanase regulator 1 (Xyr1) in Trichoderma reesei / Marion Eleonore Pucher

ger: Der Ascomycet Trichoderma reesei (teleomorph Hypocrea jecorina) produziert eine Vielfalt an hydrolytischen Enzymen, die Biopolymere, wie Cellulose oder Hemicellulose, abbauen können. Im Jahr 2006 wurde der Xylanase Regulator 1 (Xyr1), der wichtigste Transkriptionsfaktor für die Regulation von G...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
VerfasserIn:
Place / Publishing House:2010
Year of Publication:2010
Language:English
Subjects:
Classification:35.73 - Biochemische Reaktionen
42.13 - Molekularbiologie
Physical Description:[39] Bl.; Ill., graph. Darst.
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
id 990002201490504498
ctrlnum AC07809425
(AT-OBV)AC07809425
(Aleph)008355652ACC01
(DE-599)OBVAC07809425
(EXLNZ-43ACC_NETWORK)990083556520203331
collection bib_alma
institution YWOAW
building MAG1-3
record_format marc
spelling Pucher, Marion Eleonore aut
Deeper insights into the regulation of the xylanase regulator 1 (Xyr1) in Trichoderma reesei Marion Eleonore Pucher
2010
[39] Bl. Ill., graph. Darst.
Wien, Techn. Univ., Diss., 2010
ger: Der Ascomycet Trichoderma reesei (teleomorph Hypocrea jecorina) produziert eine Vielfalt an hydrolytischen Enzymen, die Biopolymere, wie Cellulose oder Hemicellulose, abbauen können. Im Jahr 2006 wurde der Xylanase Regulator 1 (Xyr1), der wichtigste Transkriptionsfaktor für die Regulation von Genen, die für hydrolytische Enzyme kodieren, gefunden.<br />Obwohl Xyr1 ein derart wichtiger Transkriptionsfaktor ist, wurde seine Regulation und Induzierbarkeit bis jetzt kaum untersucht. Die Analysen zeigten, dass die Transkription von xyr1 durch keine spezifische Substanz induziert werden kann, jedoch durch den Kohlenstoff Katabolit Repressor 1 (Cre1) und den Aktivator von Cellulasen 1 (Ace1) reprimiert wird. Der Stamm nx7, der ein de-reguliertes Xyr1 Protein trägt, zeigte bei der Kultivierung in Medium mit Xylan höhere Endo-b-1,4-xylanase und b-Xylosidase Aktivität als der Elternstamm. Die beiden Stämme wurden in einem Bioreaktor kultiviert, wobei Xylan als Kohlenstoffquelle verwendet wurde. Der Überstand der Fermentation wurde für die enzymatische Umsetzung von Hemicellulosen oder Cellulose verwendet. Der Stamm nx7 wies eine veränderte Zusammensetzung der produzierten Enzyme auf, die Biopolymere effektiver abbauen konnten.<br />Bei der Untersuchung des Einflusses von verschiedenen D-Xylose Konzentrationen auf die Transkription von Genen, die für xylanolytische Enzyme kodieren, wurde die höchste Induktion nach 3-stündiger Kultivierung in Medium mit 0,5 mM D-Xylose beobachtet. Die Transkription der Gene die für Xylanasen kodieren wird auch durch den Kohlenstoff Katabolit Repressor 1 indirekt beeinflusst, da Xyr1 bei Kultivierung in Medium mit hohen D-Xylose Konzentrationen weniger stark exprimiert wird.<br />Darauffolgende Versuche zeigten, dass nicht D-Xylose, sondern ein Metabolit des D-Xylose Stoffwechselweges die induzierende Substanz ist.
eng: The ascomycete Trichoderma reesei (teleomorphic Hypocrea jecorina) produces a huge variety of hydrolytic enzymes, which are able to degrade biopolymers, such as cellulose or hemicelluloses. In 2006, the main transcription activator of hydrolytic enzymes-encoding genes, Xylanase regulator 1 (Xyr1), was discovered. Although Xyr1 is such an important transcription factor, hardly anything was known about its regulation and inducibility. The investigations show that the transcription of xyr1 cannot be induced by a specific inducer, but it is repressed by the Carbon catabolite repressor 1 (Cre1) and by the Activator of cellulases 1 (Ace1). The strain nx7, which bears a de-regulated Xyr1, showed higher endo-b-1,4-xylanases and b-xylosidases activity compared to the parental strain during the cultivation in medium containing xylan compared to the parental strain. Both strains were cultivated in a bioreactor using xylan as carbon source. The supernatant of the fermentation was used for enzymatic conversion of hemicelluloses or cellulose. The strain nx7 showed an altered composition of the produced enzymes, which were able to degrade biopolymers more efficiently than the parental strain.<br />Further investigations were carried out in order to analyze the influence of different D-xylose concentrations on the transcription of xylanolytic enzymes-encoding genes. These analyses displayed that the highest induction could be observed after 3 hours using 0.5 mM D-xylose.<br />The transcription of xylanolytic enzymes-encoding genes is indirectly affected by Cre1, since the transcription of xyr1 is reduced during the cultivation in medium containing high D-xylose concentrations.<br />Additional experiments show that not D-Xylose but a metabolite of the D-xylose pathway is the actual inducer.<br />
Zsfassung in dt. Sprache
Trichoderma reesei s (DE-588)4222070-1
Xylanasen s (DE-588)4190389-4
Genregulation s (DE-588)4122166-7
Transkriptionsfaktor s (DE-588)4303350-7
AT-OBV ONBREB
YWOAW MAG1-3 38816-C.Stip. 2214169280004498
language English
format Thesis
Book
author Pucher, Marion Eleonore
spellingShingle Pucher, Marion Eleonore
Deeper insights into the regulation of the xylanase regulator 1 (Xyr1) in Trichoderma reesei
Trichoderma reesei (DE-588)4222070-1
Xylanasen (DE-588)4190389-4
Genregulation (DE-588)4122166-7
Transkriptionsfaktor (DE-588)4303350-7
author_facet Pucher, Marion Eleonore
author_variant m e p me mep
author_role VerfasserIn
author_sort Pucher, Marion Eleonore
title Deeper insights into the regulation of the xylanase regulator 1 (Xyr1) in Trichoderma reesei
title_full Deeper insights into the regulation of the xylanase regulator 1 (Xyr1) in Trichoderma reesei Marion Eleonore Pucher
title_fullStr Deeper insights into the regulation of the xylanase regulator 1 (Xyr1) in Trichoderma reesei Marion Eleonore Pucher
title_full_unstemmed Deeper insights into the regulation of the xylanase regulator 1 (Xyr1) in Trichoderma reesei Marion Eleonore Pucher
title_auth Deeper insights into the regulation of the xylanase regulator 1 (Xyr1) in Trichoderma reesei
title_new Deeper insights into the regulation of the xylanase regulator 1 (Xyr1) in Trichoderma reesei
title_sort deeper insights into the regulation of the xylanase regulator 1 (xyr1) in trichoderma reesei
publishDate 2010
physical [39] Bl. Ill., graph. Darst.
callnumber-raw 38816-C.Stip.
callnumber-search 38816-C.Stip.
topic Trichoderma reesei (DE-588)4222070-1
Xylanasen (DE-588)4190389-4
Genregulation (DE-588)4122166-7
Transkriptionsfaktor (DE-588)4303350-7
topic_facet Trichoderma reesei
Xylanasen
Genregulation
Transkriptionsfaktor
illustrated Illustrated
work_keys_str_mv AT puchermarioneleonore deeperinsightsintotheregulationofthexylanaseregulator1xyr1intrichodermareesei
status_str n
ids_txt_mv (AT-OBV)AC07809425
AC07809425
(Aleph)008355652ACC01
(DE-599)OBVAC07809425
(EXLNZ-43ACC_NETWORK)990083556520203331
hol852bOwn_txt_mv YWOAW
hol852hSignatur_txt_mv 38816-C.Stip.
hol852cSonderstandort_txt_mv MAG1-3
itmData_txt_mv 2011-04-28 02:00:00 Europe/Vienna
barcode_str_mv +YW17735807
callnumbers_txt_mv 38816-C.Stip.
inventoryNumbers_str_mv 2011-38816-C.Stip.
materialTypes_str_mv BOOK
permanentLibraries_str_mv YWOAW
permanentLocations_str_mv MAG1-3
inventoryDates_str_mv 20110428
createdDates_str_mv 2011-04-28 02:00:00 Europe/Vienna
holdingIds_str_mv 2214169280004498
is_hierarchy_id AC07809425
is_hierarchy_title Deeper insights into the regulation of the xylanase regulator 1 (Xyr1) in Trichoderma reesei
basiskl_str_mv 35.73 - Biochemische Reaktionen
42.13 - Molekularbiologie
basiskl_txtF_mv 35.73 - Biochemische Reaktionen
42.13 - Molekularbiologie
_version_ 1794315721040199682
fullrecord <?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?><collection xmlns="http://www.loc.gov/MARC21/slim"><record><leader>05388nam#a2200481#c#4500</leader><controlfield tag="001">990002201490504498</controlfield><controlfield tag="005">20230224191052.0</controlfield><controlfield tag="007">tu</controlfield><controlfield tag="008">110105|2010####|||######m####|||#|#eng#c</controlfield><controlfield tag="009">AC07809425</controlfield><datafield tag="015" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">OeBB</subfield><subfield code="2">oeb</subfield></datafield><datafield tag="035" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">(AT-OBV)AC07809425</subfield></datafield><datafield tag="035" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">AC07809425</subfield></datafield><datafield tag="035" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">(Aleph)008355652ACC01</subfield></datafield><datafield tag="035" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">(DE-599)OBVAC07809425</subfield></datafield><datafield tag="035" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">(EXLNZ-43ACC_NETWORK)990083556520203331</subfield></datafield><datafield tag="040" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">TUW</subfield><subfield code="b">ger</subfield><subfield code="c">OPUS</subfield><subfield code="d">ONB</subfield><subfield code="e">rakwb</subfield></datafield><datafield tag="041" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">eng</subfield></datafield><datafield tag="044" ind1=" " ind2=" "><subfield code="c">XA-AT</subfield></datafield><datafield tag="084" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">35.73</subfield><subfield code="2">bkl</subfield></datafield><datafield tag="084" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">42.13</subfield><subfield code="2">bkl</subfield></datafield><datafield tag="100" ind1="1" ind2=" "><subfield code="a">Pucher, Marion Eleonore</subfield><subfield code="4">aut</subfield></datafield><datafield tag="245" ind1="1" ind2="0"><subfield code="a">Deeper insights into the regulation of the xylanase regulator 1 (Xyr1) in Trichoderma reesei</subfield><subfield code="c">Marion Eleonore Pucher</subfield></datafield><datafield tag="264" ind1=" " ind2="1"><subfield code="c">2010</subfield></datafield><datafield tag="300" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">[39] Bl.</subfield><subfield code="b">Ill., graph. Darst.</subfield></datafield><datafield tag="502" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">Wien, Techn. Univ., Diss., 2010</subfield></datafield><datafield tag="520" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">ger: Der Ascomycet Trichoderma reesei (teleomorph Hypocrea jecorina) produziert eine Vielfalt an hydrolytischen Enzymen, die Biopolymere, wie Cellulose oder Hemicellulose, abbauen können. Im Jahr 2006 wurde der Xylanase Regulator 1 (Xyr1), der wichtigste Transkriptionsfaktor für die Regulation von Genen, die für hydrolytische Enzyme kodieren, gefunden.&lt;br /&gt;Obwohl Xyr1 ein derart wichtiger Transkriptionsfaktor ist, wurde seine Regulation und Induzierbarkeit bis jetzt kaum untersucht. Die Analysen zeigten, dass die Transkription von xyr1 durch keine spezifische Substanz induziert werden kann, jedoch durch den Kohlenstoff Katabolit Repressor 1 (Cre1) und den Aktivator von Cellulasen 1 (Ace1) reprimiert wird. Der Stamm nx7, der ein de-reguliertes Xyr1 Protein trägt, zeigte bei der Kultivierung in Medium mit Xylan höhere Endo-b-1,4-xylanase und b-Xylosidase Aktivität als der Elternstamm. Die beiden Stämme wurden in einem Bioreaktor kultiviert, wobei Xylan als Kohlenstoffquelle verwendet wurde. Der Überstand der Fermentation wurde für die enzymatische Umsetzung von Hemicellulosen oder Cellulose verwendet. Der Stamm nx7 wies eine veränderte Zusammensetzung der produzierten Enzyme auf, die Biopolymere effektiver abbauen konnten.&lt;br /&gt;Bei der Untersuchung des Einflusses von verschiedenen D-Xylose Konzentrationen auf die Transkription von Genen, die für xylanolytische Enzyme kodieren, wurde die höchste Induktion nach 3-stündiger Kultivierung in Medium mit 0,5 mM D-Xylose beobachtet. Die Transkription der Gene die für Xylanasen kodieren wird auch durch den Kohlenstoff Katabolit Repressor 1 indirekt beeinflusst, da Xyr1 bei Kultivierung in Medium mit hohen D-Xylose Konzentrationen weniger stark exprimiert wird.&lt;br /&gt;Darauffolgende Versuche zeigten, dass nicht D-Xylose, sondern ein Metabolit des D-Xylose Stoffwechselweges die induzierende Substanz ist.</subfield></datafield><datafield tag="520" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">eng: The ascomycete Trichoderma reesei (teleomorphic Hypocrea jecorina) produces a huge variety of hydrolytic enzymes, which are able to degrade biopolymers, such as cellulose or hemicelluloses. In 2006, the main transcription activator of hydrolytic enzymes-encoding genes, Xylanase regulator 1 (Xyr1), was discovered. Although Xyr1 is such an important transcription factor, hardly anything was known about its regulation and inducibility. The investigations show that the transcription of xyr1 cannot be induced by a specific inducer, but it is repressed by the Carbon catabolite repressor 1 (Cre1) and by the Activator of cellulases 1 (Ace1). The strain nx7, which bears a de-regulated Xyr1, showed higher endo-b-1,4-xylanases and b-xylosidases activity compared to the parental strain during the cultivation in medium containing xylan compared to the parental strain. Both strains were cultivated in a bioreactor using xylan as carbon source. The supernatant of the fermentation was used for enzymatic conversion of hemicelluloses or cellulose. The strain nx7 showed an altered composition of the produced enzymes, which were able to degrade biopolymers more efficiently than the parental strain.&lt;br /&gt;Further investigations were carried out in order to analyze the influence of different D-xylose concentrations on the transcription of xylanolytic enzymes-encoding genes. These analyses displayed that the highest induction could be observed after 3 hours using 0.5 mM D-xylose.&lt;br /&gt;The transcription of xylanolytic enzymes-encoding genes is indirectly affected by Cre1, since the transcription of xyr1 is reduced during the cultivation in medium containing high D-xylose concentrations.&lt;br /&gt;Additional experiments show that not D-Xylose but a metabolite of the D-xylose pathway is the actual inducer.&lt;br /&gt;</subfield></datafield><datafield tag="546" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">Zsfassung in dt. Sprache</subfield></datafield><datafield tag="689" ind1="0" ind2="0"><subfield code="a">Trichoderma reesei</subfield><subfield code="D">s</subfield><subfield code="0">(DE-588)4222070-1</subfield></datafield><datafield tag="689" ind1="0" ind2="1"><subfield code="a">Xylanasen</subfield><subfield code="D">s</subfield><subfield code="0">(DE-588)4190389-4</subfield></datafield><datafield tag="689" ind1="0" ind2="2"><subfield code="a">Genregulation</subfield><subfield code="D">s</subfield><subfield code="0">(DE-588)4122166-7</subfield></datafield><datafield tag="689" ind1="0" ind2="3"><subfield code="a">Transkriptionsfaktor</subfield><subfield code="D">s</subfield><subfield code="0">(DE-588)4303350-7</subfield></datafield><datafield tag="689" ind1="0" ind2=" "><subfield code="5">AT-OBV</subfield><subfield code="5">ONBREB</subfield></datafield><datafield tag="970" ind1="1" ind2=" "><subfield code="c">30</subfield></datafield><datafield tag="970" ind1="2" ind2=" "><subfield code="d">HS-DISS</subfield></datafield><datafield tag="970" ind1="0" ind2=" "><subfield code="a">OPUS21131</subfield></datafield><datafield tag="971" ind1="1" ind2=" "><subfield code="a">Mach, Robert L.</subfield></datafield><datafield tag="971" ind1="1" ind2=" "><subfield code="a">Graaff, Leo H. de</subfield></datafield><datafield tag="971" ind1="3" ind2=" "><subfield code="a">2010-12</subfield></datafield><datafield tag="971" ind1="4" ind2=" "><subfield code="a">Dr. techn.</subfield></datafield><datafield tag="971" ind1="5" ind2=" "><subfield code="a">Technische Universität Wien</subfield><subfield code="b">Fakultät für Technische Chemie</subfield><subfield code="c">Institut für Verfahrenstechnik, Umwelttechnik und Technische Biowissenschaften</subfield><subfield code="d">E166</subfield></datafield><datafield tag="971" ind1="8" ind2=" "><subfield code="a">Trichoderma reesei / Transkriptionsfaktor / Xylanase Regulator 1 / Xylanasen</subfield></datafield><datafield tag="971" ind1="9" ind2=" "><subfield code="a">Trichoderma reesei / transcription factor / Xylanase Regulator 1 / xylanases</subfield></datafield><datafield tag="ADM" ind1=" " ind2=" "><subfield code="b">2024-03-23 11:44:34 Europe/Vienna</subfield><subfield code="d">20</subfield><subfield code="f">System</subfield><subfield code="c">marc21</subfield><subfield code="a">2018-12-24 05:21:15 Europe/Vienna</subfield><subfield code="g">false</subfield></datafield><datafield tag="HOL" ind1="8" ind2=" "><subfield code="b">YWOAW</subfield><subfield code="h"> 38816-C.Stip. </subfield><subfield code="c">MAG1-3</subfield><subfield code="8">2214169280004498</subfield></datafield><datafield tag="852" ind1="8" ind2=" "><subfield code="b">YWOAW</subfield><subfield code="c">MAG1-3</subfield><subfield code="h"> 38816-C.Stip. </subfield><subfield code="8">2214169280004498</subfield></datafield><datafield tag="ITM" ind1=" " ind2=" "><subfield code="9">2214169280004498</subfield><subfield code="e">1</subfield><subfield code="m">BOOK</subfield><subfield code="b">+YW17735807</subfield><subfield code="i">2011-38816-C.Stip.</subfield><subfield code="2">MAG1-3</subfield><subfield code="o">20110428</subfield><subfield code="8">2314169270004498</subfield><subfield code="f">02</subfield><subfield code="p">2011-04-28 02:00:00 Europe/Vienna</subfield><subfield code="h">38816-C.Stip.</subfield><subfield code="1">YWOAW</subfield><subfield code="q">2022-06-09 11:15:42 Europe/Vienna</subfield></datafield></record></collection>